Naruto Izumaki, 12 ans

Naruto Izumaki est le héros de la série. Le démon renard qui décimait jadis le village a été scellé en lui à sa naissance. Il possède donc en lui le Chakra (l'énergie qui permet de lancer des sorts) du démon renard, un Chakra quasiment inépuisable qu'il apprendra à maîtriser petit à petit. Elève très turbulent à l'académie, il est toujours prêt à réaliser des pitreries pour se faire remarquer. Malgré ses défauts, il a énormément de courage et de volonté. Au début, il était le plus mauvais élève de l'académie, mais il s'est vite rattrapé. Son grand rêve est de devenir Hokage pour que tout le monde reconnaisse sa valeur. Il fait équipe avec Sasuke Uchiwa et Sakura Haruno. Naruto est amoureuse de cette dernière. 

Sasuke Uchiwa est un descendant de la famille Uchiwa. Il possède une technique héréditaire qui permet d'analyser et copier toutes sortes de techniques : le Sharigan. Son but est de tuer son frère Itachi qui a exterminé son clan et sa famille. Sasuke est le meilleur élève de l'académie et il avait peu de considération pour Naruto au début, mais il a vite compris que Naruto était loin d'être un être faible. Il va être entraîné personnellement par Kakashi qui va lui apprendre la technique Mille-oiseaux.

Sakura Haruno est une fille très intelligente et est une très bonne élève. Elle est amoureuse de Sasuke et tente de toujours paraître pour une fille bien, alors qu'elle a plutôt un mauvais caractère. Elle maîtrise très bien son Chakra, mais n'a pas beaucoup de force physique. Elle se dispute souvent avec son amie d'enfance Ino qui la surnomme la fille au grand front. Plus tard, elle va être entraînée par Tsunade à utiliser des techniques médicales.

Kakashi Hataké, 26 ans

L'un des ninjas les plus puissants du village de Konoha, Kakashi Hataké est un ninja de niveau supérieur et est le professeur principal de Naruto, Sasuké et Sakura. Il maîtrise la technique du Sharigan qui permet de copier les techniques des autres. Surnommé le ninja copieur pour avoir copié des milliers de techniques grâce à son Sharingan (son oeil gauche). Comme il n'est pas un descendant de la famille Uchiwa, il consomme beaucoup de Chakra à l'utilisation de son Charigan et est obligé de cacher celui-ci. Kakashi est un ancien élève du 4e Hokage. Une partie de ses secrets est dévoilée dans un épisode spécial appelé "Kakashi Gaiden", où l'origine de son Sharingan est révélée.

Gaara, 12 ans

Comme Naruto, Gaara possède un démon scellé en lui : le Shukaku du désert. Sa mére fut sacrifiée par le village de Suna afin de donner naissance à cet enfant qui devait contenir le Shukaku et ainsi devenir le ninja ultime. Il ne peut pas dormir, sous peine de voir le démon scellé en lui détruire son esprit. Il a été élevé par son oncle Yashamaru, le frère jumeau de sa mère. Craignant sa puissance destructrice, de nombreux villageois de Suna, y compris son oncle, ont tenté de le tuer sans jamais réussir à cause du sable qui le protège en permanent. Gaara pense qu'il ne peut aimer que lui-même et ne vivre que pour tuer. La rencontre avec Naruto lui fera comprendre qu'il peut aussi avoir des amis. Gaara deviendra le Kazekage de Suna plus tard.

Rock Lee, 13 ans

Surnommé "Gros Sourcils" par Naruto. Lee est incapable d'utiliser le Chakra. Il ne sait ni utiliser le Ninjutsu, ni le Genjutsu. Avant qu'il ne devienne ninja, on lui prédisait qu'il ne pourrait jamais réussir à en devenir un. Il ne fait partie d'aucun clan. Rock Lee est dans l'équipe de Hyûga Neji, son rival qu'il cherche à tout prix à surpasser. Il est amoureux de Sakura et n'hésite pas à le clamer haut et fort. Il est l'élève préféré de son maître Gai Maito. Ce dernier lui a enseigné une technique dangereuse.

Neji Hyûga, 13 ans

Membre du clan Hyûga. Comme tous les membres de son clan, il possède des pupilles blanches et maîtrise un jutsu appelé Byakugan, lui permettant de voir le chakra de ses adversaires et également voir très loin à travers des obstacles. Neji est le cousin d'Hinata.

Tenten, 13 ans

Tenten fait partie du groupe de Neji et Rock Lee. En combat, elle utilise des kunaïs et des shurikens comme armes. Elle est capable de faire apparaître des armes en utilisant une technique d'invocation à partir d'un parchemin.

Gai Maito, 26 ans

Gai est un puissant Jounin (ninja de niveau supérieur) et un grand rival de Kakashi. Très protecteur envers son élève Rock Lee, il lui a appris une technique très dangereuse.

Hinata Hyûga, 12 ans

Hinata fait partie du clan Hyûga. Elle est très timide et est secrètement amoureuse de Naruto. Elle est dans le même groupe que Shino Aburame et Kiba Inuzuka.

Iruka, 25 ans

Iruka est le professeur de l'Académie des Ninjas. Ses parents sont morts en affrontant le démon renard autrefois. Tuteur de naruto, il est le premier à croire en lui. Sa spécialité est le clonage.

Soudaine Sarutobi, 3e Hokage

C'est le chef et le ninja le plus fort du village de Konoha. Sarutobi est le 3e Hokage et est l'ancien maître des trois Sanins légendaires : Orochimaru, Jiraiya et Koichi Tsunade. Il a repris son titre de Hokage à la mort du 4e. Il connaît et maîtrise presque toutes les techniques. Malheureusement sa force diminue avec l'âge. Il peut invoquer le roi des singes Sangoku pour l'aider à se battre. Il va se battre contre Orochimaru et perdra la vie en sauvant son village.

Orochimaru, 50 ans

Autrefois, élève du 3e Hokage avec Jiraiya et Tsunade. Il est aussi un des ninjas légendaires. Il attaquera le village de Konoha et réussira à tuer Soudaine, le 3e Hokage, mais perdra la faculté d'utiliser le Ninjutsu. Il est capable d'invoquer des serpents.

Jiraiya (Ero Senin), 50 ans

Ancien élève du 3e Hokage et ancien maître du 4e Hokage. Jiraiya est l'un des trois fameux Sanins légendaires (ninjas légendaires) avec Orochimaru et Tsunade. Il aime les femmes et l'argent. Peu sérieux en apparence, il est l'auteur du livre "Le paradis de la drague". Il va refuser la place d'Hokage et tentera de convaincre Tsunade de devenir le 5e Hokage. Il deviendra le maître de Naruto. Il est capable d'invoquer des crapauds.

Koichi Tsunade, 50 ans

Une des trois ninjas légendaires. Spécialiste en médecine ninja, Tsunade est la plus forte des femmes ninjas. C'est une femme très capricieuse qui ne veut pas faire son âge. Elle a recours à certaines techniques qui lui font garder une apparence jeune. Elle a perdu son fiancé et de son petit frère autrefois. Elle est toujours accompagnée de Shizune qui la sert avec dévouement. Elle deviendra le 5e Hokage à la mort du 3e. Elle est capable d'invoquer des limaces. Naruto lui rappelle beaucoup son petit frère et du coup, elle a une affection particulière pour lui. Elle prendra Sakura sous son aile pour l'entraîner.